MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-9 DNA

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020825	TTTA	2	8	42	49	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020825	A	7	7	277	283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020825	CTA	2	6	300	305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020825	TTTA	2	8	336	343	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020825	TAG	2	6	410	415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020825	ACT	2	6	421	426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_020825	AT	3	6	594	599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020825	TCA	2	6	714	719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_020825	ATT	2	6	1252	1257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020825	TAAG	2	8	1261	1268	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020825	CGG	2	6	3154	3159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_020825	GAGC	2	8	3171	3178	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_020825	GCGTA	2	10	3205	3214	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_020825	TGA	2	6	3328	3333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020825	AAAC	2	8	3344	3351	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_020825	GAA	2	6	3383	3388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020825	CAA	2	6	3440	3445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020825	AAC	2	6	3453	3458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020825	T	6	6	3991	3996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020825	AGG	2	6	4065	4070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020825	A	6	6	4082	4087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020825	TAT	2	6	4090	4095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020825	T	6	6	4195	4200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020825	AATA	2	8	4264	4271	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020825	AAG	2	6	4401	4406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020825	CTT	2	6	4431	4436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020825	T	6	6	4438	4443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020825	A	6	6	4466	4471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020825	ATA	2	6	4481	4486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020825	CAC	2	6	4500	4505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_020825	CAA	2	6	4672	4677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_020825	AGA	2	6	4694	4699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020825	AAC	2	6	4704	4709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_020825	CAA	2	6	4777	4782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020825	TAC	2	6	4810	4815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_020825	CCG	2	6	4819	4824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_020825	AAT	2	6	4826	4831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020825	AAC	2	6	4869	4874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_020825	C	7	7	4910	4916	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
40	NC_020825	ATA	2	6	4929	4934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020825	A	6	6	4934	4939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020825	AAT	2	6	5622	5627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020825	TTA	2	6	5630	5635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020825	A	6	6	5635	5640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020825	AC	3	6	5666	5671	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_020825	CAA	2	6	5704	5709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_020825	CT	3	6	5728	5733	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_020825	CTT	2	6	5766	5771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_020825	AAC	2	6	5832	5837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.